國(guó)有企業(yè)產(chǎn)權(quán)改制基本完成以后，對(duì)大多數(shù)沒有證券資格的中小事務(wù)所來說，除了工商年檢和驗(yàn)資業(yè)務(wù)以外，主要的業(yè)務(wù)就是各種專項(xiàng)審計(jì)業(yè)務(wù)。
專項(xiàng)審計(jì)是具有特殊目的、專門（單一）用途的審計(jì)。現(xiàn)行的審計(jì)準(zhǔn)則是主要針對(duì)定期報(bào)表審計(jì)制定的。沒有專門的專項(xiàng)審計(jì)準(zhǔn)則，因?yàn)閷ｍ?xiàng)審計(jì)是政府審計(jì)或企業(yè)內(nèi)部審計(jì)業(yè)務(wù)范疇。根據(jù)用途不同，專項(xiàng)審計(jì)的程序與方法等規(guī)定分布在各有關(guān)文件中。如國(guó)有企業(yè)清產(chǎn)核資審計(jì)業(yè)務(wù)，是根據(jù)2003年9月9日國(guó)資委第1號(hào)令《國(guó)有企業(yè)清產(chǎn)核資辦法》和《清產(chǎn)核資資金核實(shí)工作規(guī)定》等四個(gè)配套規(guī)定進(jìn)行的。行政事業(yè)單位資產(chǎn)清查專項(xiàng)審計(jì)，是根據(jù)全國(guó)行政事業(yè)單位資產(chǎn)清查工作小組辦公室《關(guān)于印發(fā)中央級(jí)行政事業(yè)單位資產(chǎn)清查專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告范本等事項(xiàng)的通知》進(jìn)行的。常見的專項(xiàng)審計(jì)業(yè)務(wù)主要有：主輔分離、國(guó)企改制審計(jì)；企業(yè)擬合并、分離審計(jì)；經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計(jì)，離任審計(jì)；破產(chǎn)審計(jì)（破產(chǎn)宣告前、清算審計(jì)）；以摸清家底為目的的財(cái)務(wù)狀況專項(xiàng)審計(jì)；基本建設(shè)工程財(cái)務(wù)決算審計(jì)。
工商年檢審計(jì)雖然具有專門的用途，按照中注協(xié)的規(guī)定屬于年度財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)，不屬于專項(xiàng)審計(jì)，區(qū)別在于審計(jì)的側(cè)重點(diǎn)是注冊(cè)資本投入及使用情況，而不是企業(yè)的財(cái)務(wù)狀況和經(jīng)營(yíng)情況。
專項(xiàng)審計(jì)與年度財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)的區(qū)別主要在于審計(jì)目的、審計(jì)重點(diǎn)、重要性水平以及報(bào)告的格式不同。專項(xiàng)審計(jì)在審計(jì)方法、審計(jì)程序方面，與年度財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)執(zhí)行相同的審計(jì)準(zhǔn)則。專項(xiàng)審計(jì)的難點(diǎn)是對(duì)查出的問題如何處理以及如何出具恰當(dāng)?shù)膶徲?jì)報(bào)告。現(xiàn)就我自己的工作體會(huì)，就專項(xiàng)審計(jì)應(yīng)的幾個(gè)問題與同仁一起商榷。
一、專項(xiàng)審計(jì)的重要性水平
專項(xiàng)審計(jì)的重要性水平不能套用年度財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)的重要性水平。假如你的專項(xiàng)審計(jì)被認(rèn)定審計(jì)失敗，你辯稱沒有超過年度財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)通用的重要性水平是無效的。因?yàn)閷ｍ?xiàng)審計(jì)的重要性水平與年度財(cái)務(wù)報(bào)表的重要性水平是不同的，一般來說要比年報(bào)審計(jì)的重要性水平低一些。
一般情況下，專項(xiàng)審計(jì)的重要性水平是注冊(cè)會(huì)計(jì)師根據(jù)委托方的審計(jì)目標(biāo)確定的。委托人要求的審計(jì)目標(biāo)達(dá)到什么程度，就是應(yīng)該設(shè)定的重要性水平。由于各種專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告的審計(jì)目標(biāo)不同，不可能設(shè)定一個(gè)適合于各種專項(xiàng)審計(jì)的重要性水平，比如企業(yè)改制審計(jì)，凡是影響凈資產(chǎn)的，只要證據(jù)確鑿，不論金額大小，都要調(diào)整。再如對(duì)納稅情況進(jìn)行專項(xiàng)審計(jì)，只要證據(jù)確鑿，不論金額大小都是重要的，都要進(jìn)行調(diào)整。
從廣義的角度來看，年度財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)的重要性水平，也是根據(jù)委托方的審計(jì)目標(biāo)確定的，比如上市公司年報(bào)審計(jì)的重要性水平，是根據(jù)財(cái)務(wù)報(bào)告使用者利用會(huì)計(jì)報(bào)表數(shù)據(jù)判斷企業(yè)經(jīng)營(yíng)情況的審計(jì)目標(biāo)確定的；國(guó)有企業(yè)年報(bào)審計(jì)的重要性水平，是根據(jù)國(guó)資委對(duì)會(huì)計(jì)報(bào)表的審計(jì)目標(biāo)確定的。因此，專項(xiàng)審計(jì)的重要性水平的確定，與年度財(cái)務(wù)報(bào)表審計(jì)本質(zhì)上沒有區(qū)別。